Le comité central du Frelimo, qui compte quelque 250 membres, a élu M. Chapo face à trois autres candidats internes, dans une décision surprise annoncée à l'issue de plus de deux jours de débats intenses, plusieurs votes successifs et enfin le retrait de son plus proche rival.
La Constitution empêche Nyusi, 65 ans, de briguer un troisième mandat le 9 octobre, lorsque les Mozambicains éliront aussi leur Parlement et autorités provinciales.
En octobre dernier, plusieurs personnes ont été tuées lors de manifestations monstres pour dénoncer les résultats jugés truqués des élections locales. La police avait ouvert le feu sur les manifestants dans plusieurs villes.
La Renamo, dénonçant des fraudes et revendiquant notamment une victoire à Maputo, avait appelé à manifester après que le Frelimo ait été déclaré vainqueur dans 64 des 65 municipalités en jeu.
Plus de 5 000 personnes ont été tuées et près d'un million ont dû fuir leurs foyers depuis le début des violences.